西藏自治区藏医院始建于1916年，前身为拉萨门孜康，已有上百年的发展历史。目前已发展成为全国规模最大的集医疗、教学、科研、预防、保健和藏药制剂生产为一体的三级甲等藏医医院。 医院致力提升综合服务能力，总建筑面积约10万平方米，设立门诊部、住院部、制剂室、藏医药研究院、国家民族医临床研究基地、药材种植基地等六大功能区。2019年，开设519张病床，设有临床专业科室21个，临床医技科室5个、研究所4个、职能处室11个，国家中医药管理局重点学科3个，国家中医药管理局重点专科4个，国家中医药管理局培育专科3个，国家临床重点专科3个，国家级重点研究室3个，各级实验室2个，国家中医药管理局名医工作室7个，国医大师2名，门急诊接诊达41.19万人次，医院规模与实力位居全国藏医院前列。 在党中央、国务院以及西藏自治区党委政府、国家中医药管理局、区卫健委、藏医药管理局的高度重视和大力扶持下，医院1996年被国家中医药管理局授予全国示范藏医院，2005年被评为全国首家“三级甲等”藏医院，2008年被认定为国家药物临床试验机构，胃肠科、内科等6个专科取得临床试验资格；2008年确定为全国唯一一家重点研究民族医临床研究基地建设单位，并于2017年通过国家验收；医院已加盟北京同仁医院牵头的“全国眼科联盟成员单位”，成为全国首批成员；设立“中国中医科学院针灸医院西藏针灸临床中心”；与北京大学口腔医院签署了战略合作协议书；2017年挂牌“西藏藏医学院临床教学医院”；2018年“西藏自治区眼科中心”挂牌成立；设立“西藏自治区藏医院风湿病研究羊八井基地”。 医院始终将“充分发挥藏医药特色与优势”作为发展的主旋律，在常见病、多发病和多种疑难病症的诊治方面，充分应用藏医药独特治疗方法和高原得天独厚的天然药材资源，取得了显著的临床疗效，在国内外具有广泛影响。

借助国家民族医临床研究基地及藏医药研究院，以及国家重点专科等平台，开展专科基础设施建设，病种诊疗方案及其标准的研究制定，诊疗行为的规范化，专科学科带头人的培养等工作，形成33个优势病种藏医诊疗方案，十几个藏医诊疗路径和标准，研发专科藏药28种，设立传统疗法中心，开展22项适宜技术，肝硬化等专科重点病种藏医临床疗效显著提高，发挥藏医药特色优势明显，在发展历程中受到自治区党委、政府和社会各界的高度评价并给予了诸多荣誉。 医院始终注重和实施文献、科研工作，相续编撰出版在国内外深具影响的《雪域藏医历算大典》、《西藏万年历》等130多部文献研究著作和《藏医药学名词》、《藏医骨伤名词术语》等3部藏医药标准化研究著作，搜集整理强巴赤列老院长的文稿、著作、论文汇成8部文集。实施藏医药产业技术与服务平台项目10部文献编著和《百科全书·藏医分卷》《常见病藏医临床诊疗手册》《藏医护理规范》《藏西医家庭医疗手册》《嘎玛曲培传记》《骨伤术语》等诸多书籍的编著；收录175名藏医药及天文历算专家学者的口述史资料。治疗糖尿病新药“糖康复胶囊”获得国家食品药品监督管理局新药临床研究批件，实施完成“三果汤”等三个医院制剂剂改研究，完成300种藏药制剂整理；“雪域藏医历算大典”和“藏医催泻疗法治疗黄疸型肝炎”成果分别荣获2018年度自治区科技奖二等奖、三等奖；《21部藏医药古籍文献整理研究》和《藏医四肢解剖图解》荣获2019年中国民族医药协会科技著作一等奖；