平潭县中医院创建于1985年12月，是由当时的平潭县政府招待所改建而成。医院占地面积6010平方米，建筑面积10126平方米，业务用房 5837.5平方米 。建院二十多年来，在上级党委、政府和卫生主管部门的正确领导下，在医院历任领导和医务员工的共同奋斗下，医疗环境不断改善，医疗功能不断完善，中医药服务能力不断提升，综合实力不断增强，医德医风不断优化，成为平潭中医、中西医结合的医疗、教学、科研、康复预防保健技术中心，是平潭综合实验区目前唯一的一所二级乙等中医医疗机构。

医院现为福建中医药大学附属人民医院协作医院，福建中医药大学附属第二人民医院健康体检分中心，中医特色浓厚，中西医结合优势突出。现有编制病床位 200张(2013年6月获得福建省卫生厅审批扩增编制病床位100张)，实际开放100张。设有中西医结合内科、外科、骨伤科、妇产科、儿科、五官科、肛肠科、康复科、门急诊科、健康体检科等临床科室，下设消化脾胃专科、内分泌糖尿病专科 、中医肝病专科等

医院坚持“以人为本、传承创新、医技领先、彰显博爱”的人文精神，树立“以病人为中心，低费用、高疗效”的服务理念，以福建中医药大学附属人民医院、附属第二人民医院协作帮扶为契机，以 “创先争优，实现科学跨越式发展”为目标，以建设“三好一满意”医院为抓手，以良好的医德医风、精湛的技术水平、优质的医疗服务对待每一位病患者，不断充实医院内涵建设，提升整体综合实力，提高医疗服务水平，争创“二甲”中医院，为广大人民群众的健康造福，为平潭综合实验区的建设发展发挥医疗机构应有的保障作用。

设有放射科、CT室、B超室、检验科、内窥镜室、心电图室等医技科室，尤其是检验科与跨地区连锁经营的独立医学实验室 ----艾迪康医学检验中心合作，采取欧美独立实验室的先进管理体系，引进国际高端质量标准，可开展220多项特色项目、1100多项检测项目，进一步提升了检测服务的品质与效率，可满足临床和体检工作需求。中医内科、中医肝病专科、中医消化脾胃专科、中医妇科、康复科、检验科、B超室等为特色科室。